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EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫有什么用

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在已有的lncRNA數(shù)據(jù)庫中,包含了兩種類型的lncRNA, 一種是實(shí)驗(yàn)手段證實(shí)過的lncRNA, 另外一種是軟件預(yù)測出來的lncRNA,其中軟件預(yù)測的結(jié)果是存在很多的假陽性的。

EVlncRNAs是目前最大的實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的lncRNA數(shù)據(jù)庫,收錄了來自動(dòng)物,植物,微生物共77個(gè)物種,1543個(gè)lncRNA, 除了染色體位置,外顯子個(gè)數(shù),長度等基本信息外,還提供了lncRNA相關(guān)的疾病,lncRNA功能注釋,lncRNA與其他分子的相互作用等信息,數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址如下

http://biophy.dzu.edu.cn/EVLncRNAs/

H19這個(gè)lncRNA為例,包含了以下幾種信息

1. 基本信息

包括lncRNA id, name, 染色體定位,外顯子個(gè)數(shù),轉(zhuǎn)錄本編號等基本信息,示意如下

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2. lncRNA相關(guān)疾病

通過整合了lncRNADisease, lnc2Cancer等數(shù)據(jù)庫以及已經(jīng)發(fā)表的文獻(xiàn),提供了lncRNA相關(guān)的疾病信息,示意如下

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3.  功能注釋

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4.  相互作用

包括了lncRNA與miRNA, protein, TF等相互作用信息,示意如下

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該數(shù)據(jù)庫中的信息是免費(fèi)下載的,示意如下

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文章題目:EVLncRNAs數(shù)據(jù)庫有什么用
當(dāng)前路徑:http://aaarwkj.com/article2/pegiic.html

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