linux服務(wù)器安裝R語(yǔ)言及Rstudio server

在linux服務(wù)器上使用R語(yǔ)言及Rstudio server

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cat /etc/redhat-release: 查看服務(wù)器系統(tǒng)版本

wget

checking for rl_callback_read_char in -lreadline... no

configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available

configure: WARNING: you cannot build info or HTML versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of the R manuals

configure: WARNING: you cannot build PDF versions of vignettes and help pages

6.安裝

make

make install

安裝成功！

R #在命令行直接輸入“R”即可進(jìn)入R 編輯。

q() ##退出R編輯

7.安裝R-studio-server

wget

yum install rstudio-server-rhel-1.2.1335-x86_64.rpm

8.R-studio-server的一些命令

rstudio-server start ##啟動(dòng) rstudio

rstudio-server stop ## 關(guān)閉rstudio

rstudio-server status ## 查看rstudio 運(yùn)行狀態(tài)

運(yùn)行rstudio-server status出現(xiàn) “Active: active (running) ” 表示rstudio 已啟動(dòng)

rstudio-server verify-installation ## 查看rstudio 安裝錯(cuò)誤

rstudio-server restart ##重啟

ifconfig ##查看服務(wù)器ip地址。

查看運(yùn)行中R進(jìn)程

rstudio-server active-sessions

指定PID，停止運(yùn)行中的R進(jìn)程

rstudio-server suspend-session pid

停止所有運(yùn)行中的R進(jìn)程

rstudio-server suspend-all

強(qiáng)制停止運(yùn)行中的R進(jìn)程，優(yōu)先級(jí)最高，立刻執(zhí)行

rstudio-server force-suspend-session pid

rstudio-server force-suspend-all

RStudio Server臨時(shí)下線，不允許web訪問(wèn)，并給用戶友好提示

rstudio-server offline

RStudio Server臨時(shí)上線

rstudio-server online

8.rstudio-server系統(tǒng)設(shè)置

主要有兩個(gè)配置文件，默認(rèn)文件不存在（非必要，可不做修改）

/etc/rstudio/rserver.conf

/etc/rstudio/rsession.conf

vi /etc/rstudio/rserver.conf

www-port=8080#監(jiān)聽(tīng)端口,默認(rèn)是8787，可以不做修改

www-address=127.0.0.0#允許訪問(wèn)的IP地址，默認(rèn)0.0.0.0

rstudio-server restart

vi /etc/rstudio/rsession.conf

session-timeout-minutes=30#會(huì)話超時(shí)時(shí)間

r-cran-repos= #CRAN資源庫(kù)

rsession-which-r=/usr/local/bin/R ## 如果非root安裝，更改R所在目錄。

9.通過(guò)瀏覽器連接Rstudio-server

直接打開(kāi)瀏覽器，輸入;服務(wù)器ip:8787 ## 如果修改過(guò)rserver.conf文件，后面的8787端口改為相應(yīng)的端口即可。

這里需要我們輸入用戶名和密碼。關(guān)于用戶名有2點(diǎn)注意事項(xiàng)：

（1）.不允許使用system 用戶登陸，即用戶ids小于100的用戶。只能用普通用戶登錄

（2）.用戶的認(rèn)證可以使用RSA。

如果沒(méi)有普通用戶，可以添加：

useradd newname # 添加一個(gè)名為newname的用戶

passwd newname ###給新用戶newname 設(shè)置密碼，密碼需是復(fù)雜密碼，否則可能通不過(guò)。

usermod -G happy newname ####將新用戶newname添加到happy 用戶組中，

在用useradd添加用戶之后，在默認(rèn)的情況下，該賬號(hào)是暫時(shí)被封鎖的， 也就是說(shuō)，該賬號(hào)是無(wú)法登錄，須要用passwd命令來(lái)給新創(chuàng)建的用戶設(shè)置密碼之后才可以使用。

10可能存在的問(wèn)題

10.1如果你的rstudio-server沒(méi)有啟動(dòng) 很大程度是安裝有誤，這里我將我遇到的錯(cuò)誤分享出來(lái)

rstudio-server verify-installation

There is a libR.so in /usr/lib/R/lib, but (weirdly) ls -l reveals that

it dates from the my previous install of R-3.5.1 for which I did not

configure with --enable-R-shlib.

這里就提到無(wú)法找到libR.so文件，原因是配置R語(yǔ)言文件時(shí)，沒(méi)有加參數(shù)--enable-R-shlib.

這就必須要重新安裝R語(yǔ)言。使用make uninstall 刪除之前的安裝，最好也刪除R-3.6.1所在的文件夾，用“rm -r -f R-3.6.1".

使用rm 命令 -r 參數(shù)表示全部刪除， -f 參數(shù)表示強(qiáng)制刪除，不會(huì)提醒。 同時(shí)使用這兩個(gè)參數(shù)要小心。

10.2 普通用戶無(wú)法啟動(dòng)rstudio-server

sudo rstudio-server start## 以管理員方式執(zhí)行命令

這時(shí)會(huì)需要輸入密碼并提示

xxx is not in the sudoers file.This incident will be reported.

如果不想出現(xiàn)上面的提示，就是給該用戶提高權(quán)限，添加用戶使用sudo的權(quán)利。

su root ###切換到root用戶，如果有root權(quán)限的話。

chmod u+w /etc/sudoers ###添加sudo文件的寫權(quán)限

vi /etc/sudoers ###編輯sudoers文件，添加權(quán)限。

找到這行 root ALL=(ALL) ALL,在他下面添加xxx ALL=(ALL) ALL (這里的xxx是你的用戶名)

youuser ALL=(ALL) ALL

%youuser ALL=(ALL) ALL

youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL

%youuser ALL=(ALL) NOPASSWD: ALL

chmod u-w /etc/sudoers ##撤銷sudoers文件寫權(quán)限

r語(yǔ)言是什么專業(yè)學(xué)的,r語(yǔ)言是什么語(yǔ)言

1.R語(yǔ)言常用在數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析、數(shù)據(jù)繪圖和數(shù)據(jù)挖掘，是一種編程語(yǔ)言和操作環(huán)境。

2.R語(yǔ)言可以下載源代碼進(jìn)行使用，甚至已經(jīng)編譯的可執(zhí)行文件也能直接下載使用。

3.R語(yǔ)言不只局限于一個(gè)平臺(tái)，可以在常見(jiàn)的Windows系統(tǒng)、MACOS中運(yùn)行使用，也可以在freeBSD和Linux中運(yùn)行。

4.R語(yǔ)言可以利用用戶編寫的包增強(qiáng)，添加R語(yǔ)言中的統(tǒng)計(jì)、繪圖和IN/OUT功能，可以在經(jīng)濟(jì)計(jì)量、人文統(tǒng)計(jì)中使用。

5.R語(yǔ)言的優(yōu)勢(shì)如下：R語(yǔ)言是編程小白的入門語(yǔ)言，語(yǔ)法結(jié)構(gòu)較為簡(jiǎn)單，而且容易學(xué)習(xí)，特別是工作中要使用繪圖、統(tǒng)計(jì)時(shí)，學(xué)習(xí)R語(yǔ)言會(huì)非常有優(yōu)勢(shì)。

6.R語(yǔ)言是開(kāi)源軟件，是免費(fèi)的，學(xué)習(xí)時(shí)能大大減少成本。

7.在R語(yǔ)言的內(nèi)部，有完善的幫助系統(tǒng)，學(xué)習(xí)中可以根據(jù)實(shí)例進(jìn)行查漏補(bǔ)缺。

8.R語(yǔ)言是命令行操作方式，在使用中會(huì)更加的靈活，適合初學(xué)者入門學(xué)習(xí)，在數(shù)據(jù)分析和內(nèi)容編程中有更好的體驗(yàn)。

9.R語(yǔ)言的安裝包僅為40M，相比其他的語(yǔ)言可以說(shuō)非常的小了。

10.R語(yǔ)言在世界范圍的使用率非常廣，在職業(yè)的規(guī)劃中R語(yǔ)言很有幫助。

Linux系統(tǒng)R語(yǔ)言安裝（Ubuntu 18.04，apt安裝）

首先創(chuàng)建CPAN的環(huán)境

然后進(jìn)行R語(yǔ)言主程序的安裝：

將CRAN上R包的index讀取到本地：

R包安裝（示例）：

以上

如何在linux環(huán)境下使用r語(yǔ)言

1、下載

wget

2、解壓：

tar -zxvf

R-3.0.1.tar.gz

cd R-3.0.1

3、安裝 (當(dāng)然也可以跳過(guò))

yum

install readline-devel

yum install libXt-devel

./configure

4、 配置環(huán)境并編譯安裝

#

如果使用rJava需要加上 --enable-R-shlib

(這個(gè)我不需要，所以加入到后面)

# 如果3沒(méi)安裝, 那么后面加上： --with-readline=no

--with-x=no

./configure --prefix=/usr/R-3.0.1

make $$ make install

5、配置環(huán)境變量并生效

vi

.bash_profile

export R_HOME=/usr/R-3.0.1

export PATH=.:$R_HOME/bin:$PATH

# 試環(huán)境變量生效

source .bash_profile

6、 命令行測(cè)試

[admin@JD

software]$ R

WARNING: ignoring environment value of R_HOME

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"

Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing

Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)

R是自由軟件，不帶任何擔(dān)保。

在某些條件下你可以將其自由散布。

用'license()'或'licence()'來(lái)看散布的詳細(xì)條件。

R是個(gè)合作計(jì)劃，有許多人為之做出了貢獻(xiàn).

用'contributors()'來(lái)看合作者的詳細(xì)情況

用'citation()'會(huì)告訴你如何在出版物中正確地引用R或R程序包。

用'demo()'來(lái)看一些示范程序，用'help()'來(lái)閱讀在線幫助文件，或

用'help.start()'通過(guò)HTML瀏覽器來(lái)看幫助文件。

用'q()'退出R.

q()

7、創(chuàng)建腳本測(cè)試(t.R)

cd

/opt/script/R

vim t.R

#!/path/to/Rscript

#第一行

x-c(1,2,3)

#R語(yǔ)言代碼

y-c(102,299,301)

model-lm(y~x)

summary(model)

8、測(cè)試：執(zhí)行腳本

R CMD BATCH

--args /opt/script/R/t.R

more

/opt/script/R/t.Rout

#查看執(zhí)行的結(jié)果

或者第二種方式

Rscript

/opt/script/R/test.R

#結(jié)果直接輸出到終端

網(wǎng)站欄目：linux命令r語(yǔ)言,linux運(yùn)行r語(yǔ)言
URL鏈接：http://aaarwkj.com/article38/dsshopp.html

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