假如你有兩個(gè)表格:每個(gè)表格中有至少兩列或者好多列,如下圖例子中用到的表格只有3列,以空格分隔,第一列是名稱,第二列是觀察值,第三列也是觀測值。
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你想根據(jù)兩個(gè)文件中共有的某一列的值算相關(guān)性:
首先根據(jù)兩個(gè)文件中共同列求交集,然后輸出交集部分的指定列的信息。
比如,兩個(gè)文件中都有第一列的信息,然后輸出第一個(gè)文件中第三列,和第二個(gè)文件中第三列的信息。
輸出文件為一個(gè)新生成的表格。
該表格具有三列:
第一列為兩個(gè)文件中共有列的共有數(shù)據(jù);
第二列和第三列分別是來自第一個(gè)文件中指定列和第二個(gè)文件中的指定列。
然后用第二個(gè)腳本(R腳本)畫相關(guān)性圖:
畫相關(guān)性的腳本也支持將數(shù)據(jù)取對數(shù)log或者非log形式:
基本參數(shù) -a -b,兩個(gè)輸入文件,必須加
選擇性參數(shù):這些參數(shù)都有默認(rèn)值,看清楚即可。
-ka,-kb 表示a文件的key列,b文件的key列,就是共有列,要以這兩列為key去提取。
-va,-vb 表示a文件的value列,b文件的value列,就是你要比較的數(shù)據(jù)的值所在的列,可以使數(shù)字類型,也可以是字符串類型的值。
-sa,-sb 表示a文件的分割符,b文件的分隔符。
-headera,-headerb 加了哪個(gè)表示那個(gè)文件有header,不加表示沒有header。
-f [布爾類型] 表示是否計(jì)算數(shù)值占總體的比例,默認(rèn)False不計(jì)算。
-u [布爾類型] 表示輸出key列的并集(合集),默認(rèn)不加-u參數(shù)。
1)美化圖片,配色,線條需要美化一下下。
2)偏離點(diǎn)如何查看,什么意義?
*20200501:支持以“comma”,“,”分割的文件,只需在參數(shù)-sa或-sb中設(shè)置comma即可
該腳本已經(jīng)發(fā)展成為了根據(jù)兩個(gè)文件中共有的某一列來提取相關(guān)信息的腳本。
這兩個(gè)腳本在個(gè)人的項(xiàng)目中非常實(shí)用。經(jīng)常用來做相關(guān)性圖,因此寫成通用工具更加方便。
當(dāng)然如果你已經(jīng)有了第一步結(jié)果的表格,直接用第二個(gè)R腳本畫圖即可。
python腳本使用的全部為python內(nèi)置的包,無需安裝其他包,測試使用的是python 2.7及python3中都適用。
R腳本需要安裝ggplot2. 測試使用的R版本為 3.5.1
需要腳本的點(diǎn)贊并私信我哦。
用python進(jìn)行相關(guān)性分析應(yīng)該主要根據(jù)數(shù)據(jù)的內(nèi)容進(jìn)行分析,如果是帶標(biāo)注的數(shù)據(jù)可以通過模型訓(xùn)練的方式來獲取進(jìn)行分析,找出對目標(biāo)結(jié)果有最大影響的因素。如果沒有標(biāo)注的話,可以用python構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)知識圖譜手動分析,或者自己構(gòu)建數(shù)據(jù)表格,人為觀察數(shù)據(jù)分布圖找到其中規(guī)律。一般來說相關(guān)性分析,主要依靠人為的觀察,并用數(shù)據(jù)和模型來輔助計(jì)算,從而獲得相對準(zhǔn)確的結(jié)果。
方法/步驟
第一步我們首先需要知道相關(guān)性主要有兩個(gè)方向,一個(gè)是正方向一個(gè)是負(fù)方向,相關(guān)性系數(shù)是衡量兩個(gè)變量之間影響程度,如下圖所示:
請點(diǎn)擊輸入圖片描述
第二步下面通過公式計(jì)算兩個(gè)變量之間相關(guān)性系數(shù),代碼如下:
import numpy
import pandas
X = [52,19,7,33,2]
Y = [162,61,22,100,6]
#公式計(jì)算#均值XMean = numpy.mean(X)
YMean = numpy.mean(Y)
#標(biāo)準(zhǔn)差XSD = numpy.std(X)
YSD = numpy.std(Y)
#z分?jǐn)?shù)ZX = (X-XMean)/XSD
ZY = (Y-YMean)/YSD#相關(guān)系數(shù)
r = numpy.sum(ZX*ZY)/(len(X))
print(r)
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第三步運(yùn)行程序,可以得到相關(guān)性系數(shù)r ,r的值是0.999674032661831,相關(guān)性非常高,如下圖所示:
請點(diǎn)擊輸入圖片描述
第四步我們也可以通過numpy的corrcoef方法計(jì)算相關(guān)性系數(shù),輸入代碼
t=numpy.corrcoef(X,Y)
print(t)
可以看到X與Y和Y與X的相關(guān)性系數(shù),如下圖所示:
請點(diǎn)擊輸入圖片描述
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第五步我們也可以通過pandas的corr方法計(jì)算相關(guān)性系數(shù),代碼
data = pandas.DataFrame({'X':X,'Y':Y})
t2=data.corr()
print(t2)
得到了相同的結(jié)果,如下圖所示:
請點(diǎn)擊輸入圖片描述
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scipy.stats.pearsonr(x, y)
x和y為相同長度的兩組數(shù)據(jù)
返回值 r, p-value
r是相關(guān)系數(shù),取值-1~1. 表示線性相關(guān)程度
p-value越小,表示相關(guān)程度越顯著。按照文檔的說法“The p-values are not entirely reliable but are probably reasonable for datasets larger than 500 or so.”,p-value在500個(gè)樣本值以上有較高的可靠性
1. 運(yùn)算優(yōu)先級
括號、指數(shù)、乘、除、加、減
2
如果你使用了非 ASCII 字符而且碰到了編碼錯(cuò)誤,記得在最頂端加一行 # -- coding: utf-8 --
3. Python格式化字符
使用更多的格式化字符。例如 %r 就是是非常有用的一個(gè),它的含義是“不管什么都打印出來”。
%s -- string
%% 百分號標(biāo)記 #就是輸出一個(gè)%
%c 字符及其ASCII碼
%s 字符串
%d 有符號整數(shù)(十進(jìn)制)
%u 無符號整數(shù)(十進(jìn)制)
%o 無符號整數(shù)(八進(jìn)制)
%x 無符號整數(shù)(十六進(jìn)制)
%X 無符號整數(shù)(十六進(jìn)制大寫字符)
%e 浮點(diǎn)數(shù)字(科學(xué)計(jì)數(shù)法)
%E 浮點(diǎn)數(shù)字(科學(xué)計(jì)數(shù)法,用E代替e)
%f 浮點(diǎn)數(shù)字(用小數(shù)點(diǎn)符號)
%g 浮點(diǎn)數(shù)字(根據(jù)值的大小采用%e或%f)
%G 浮點(diǎn)數(shù)字(類似于%g)
%p 指針(用十六進(jìn)制打印值的內(nèi)存地址)
%n 存儲輸出字符的數(shù)量放進(jìn)參數(shù)列表的下一個(gè)變量中
%c 轉(zhuǎn)換成字符(ASCII 碼值,或者長度為一的字符串)
%r 優(yōu)先用repr()函數(shù)進(jìn)行字符串轉(zhuǎn)換(Python2.0新增)
%s 優(yōu)先用str()函數(shù)進(jìn)行字符串轉(zhuǎn)換
%d / %i 轉(zhuǎn)成有符號十進(jìn)制數(shù)
%u 轉(zhuǎn)成無符號十進(jìn)制數(shù)
%o 轉(zhuǎn)成無符號八進(jìn)制數(shù)
%x / %X (Unsigned)轉(zhuǎn)成無符號十六進(jìn)制數(shù)(x / X 代表轉(zhuǎn)換后的十六進(jìn)制字符的大小寫)
%e / %E 轉(zhuǎn)成科學(xué)計(jì)數(shù)法(e / E控制輸出e / E)
%f / %F 轉(zhuǎn)成浮點(diǎn)數(shù)(小數(shù)部分自然截?cái)啵?/p>
%g / %G : %e和%f / %E和%F 的簡寫
%% 輸出%
輔助符號 說明
* 定義寬度或者小數(shù)點(diǎn)精度
- 用做左對齊
+ 在正數(shù)前面顯示加號(+)
sp 在正數(shù)前面顯示空格
# 在八進(jìn)制數(shù)前面顯示零(0),在十六進(jìn)制前面顯示“0x”或者“0X”(取決于用的是“x”還是“X”)
0 顯示的數(shù)字前面填充“0”而不是默認(rèn)的空格
m.n m 是顯示的最小總寬度,n 是小數(shù)點(diǎn)后的位數(shù)(如果可用的話)
文章名稱:Python求相關(guān)性函數(shù) python 相關(guān)性系數(shù)
地址分享:http://aaarwkj.com/article8/dooodop.html
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