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vasp中l(wèi)inux命令 vasp instructor

安裝vasp時(shí),出現(xiàn)如下錯(cuò)誤,應(yīng)該怎么解決,求助

可以考慮使用 KPAR 并行,這個(gè)經(jīng)測試沒問題 順便搜了一下vasp并行策略的問題,根據(jù)guan 方的PPT里說的,KPAR是k點(diǎn)并行是最有效率的,NPAR是能帶并行次之。

成都創(chuàng)新互聯(lián)公司專注于成都網(wǎng)站制作、成都網(wǎng)站設(shè)計(jì)、網(wǎng)頁設(shè)計(jì)、網(wǎng)站制作、網(wǎng)站開發(fā)。公司秉持“客戶至上,用心服務(wù)”的宗旨,從客戶的利益和觀點(diǎn)出發(fā),讓客戶在網(wǎng)絡(luò)營銷中找到自己的駐足之地。尊重和關(guān)懷每一位客戶,用嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膽B(tài)度對待客戶,用專業(yè)的服務(wù)創(chuàng)造價(jià)值,成為客戶值得信賴的朋友,為客戶解除后顧之憂。

vasp運(yùn)行中斷,出現(xiàn)unknown怎么回事 檢查下你的POSCAR是否有問題。

段錯(cuò)誤了,沒有運(yùn)行,只看程序的錯(cuò)誤有fin=fopen(pdata,r);沒有檢查fin的有效性,當(dāng)打開文件失敗時(shí),訪問fin會造成段錯(cuò)誤,去掉引號中的空格,并檢查fin是否有效。

集群上使用的是openmpi,PBS有點(diǎn)問題,所以我一直用命令“mpirun -np 8 vasp”提交任務(wù)。不知道如何使用命令進(jìn)行多節(jié)點(diǎn)的并行計(jì)算(把一個(gè)任務(wù)分配到多個(gè)節(jié)點(diǎn)上)。

POTCAR 將要告訴vasp計(jì)算的系統(tǒng)中所包含的各種元素的贗勢 pesudopotential,vasp本身就帶有比較完善的贗勢包,我們需要做的就是選擇我們需要具體哪種贗勢,然后把相應(yīng)的文件拷貝形成我們具體的POTCAR文件。我們以GaAs為例。

求助Linux系統(tǒng)下MS5.5和VASP的計(jì)算

不知道你是想要vasp的并行安裝過程還是vasp的并行執(zhí)行。 由于知道不能提供文檔上傳,所以有需要的話可以給我發(fā)站內(nèi)信息。我用郵箱把我自己寫的vasp安裝過程給你發(fā)過去。

如果是集群,還需提交作業(yè)的腳本 vasp.job 如下 提交作業(yè) 計(jì)算結(jié)束后, cat out 查看體系是否收斂,如收斂則進(jìn)入下一步計(jì)算。

單從軟件上手、使用、分析數(shù)據(jù)角度,毫無疑問是VASP更方便,但是ASTEP(Linux)現(xiàn)在學(xué)術(shù)免費(fèi),可以向guan 方申請得到的比較新的版本(CASTEP19),而MS-CASTEP據(jù)我所知里面的CASTEP模塊是比較老的版本(具體哪個(gè)版本不確定)。

Linux系統(tǒng)中aaa-vasp.sh是什么意思

linux中.sh文件是腳本文件,一般都是bash腳本。腳本文件英文為Script。實(shí)際上腳本就是程序,一般都是由應(yīng)用程序提供的編程語言。

sh命令是shell命令語言解釋器,執(zhí)行命令從標(biāo)準(zhǔn)輸入讀取或從一個(gè)文件中讀取。通過用戶輸入命令,和內(nèi)核進(jìn)行溝通!Bourne Again Shell (即bash)是自由軟件基金會(GNU)開發(fā)的一個(gè)Shell,它是Linux系統(tǒng)中一個(gè)默認(rèn)的Shell。

sh是linux中運(yùn)行shell的命令,是shell的解釋器,shell腳本是linux中殼層與命令行界面,用戶可以在shell腳本輸入命令來執(zhí)行各種各樣的任務(wù)。

sh或是執(zhí)行腳本,或是切換到sh這個(gè)bash里,默認(rèn)的shell是bash,你可以試試tcsh啊,csh啊,ksh,zsh什么的,看看別的shell是什么樣子的。當(dāng)然,linux中sh是鏈接到bash上的,所以sh與bash在功能上是沒有區(qū)別的。

因?yàn)閕p.sh是個(gè)腳本,所在的位置,并沒有加到PATH這個(gè)環(huán)境變量里。所以運(yùn)行時(shí),系統(tǒng)搜不到這個(gè)命令,要執(zhí)行:./ip.sh 告訴系統(tǒng)這個(gè)腳本在當(dāng)前目錄下。

第一行的“#! /bin/sh”不要少。有了這行定義,系統(tǒng)就知道你寫的是一個(gè)shell腳本,另外你的腳本缺少可執(zhí)行權(quán)限,需要使用chmod +x aaa.sh命令將可執(zhí)行權(quán)限添加上去,這樣,就可以使用./aaa.sh來執(zhí)行這個(gè)腳本了。

vasp運(yùn)行中斷,出現(xiàn)unknown怎么回事

1、出現(xiàn)這種情況一般從硬件和軟件兩個(gè)方面考慮,硬件方面主要發(fā)生在內(nèi)存上,軟件方面則有可能是電腦中病毒了,收到了病毒程序的干擾,或是安裝了一些與自身電腦不兼容的軟件等。

2、應(yīng)該是內(nèi)存不足,沒有寫入EIGENVAL文件 不過也沒有關(guān)系,實(shí)際上此時(shí)的能量本征值都寫入了OUTCAR了。也很容易從這兒提取能帶的信息。

3、unknown software exception (0x*00000**),位置為0x0***0 這個(gè)問題大多是殺毒殘留,但也有可能是你卸載某個(gè)軟件不正確留下的注冊表殘留。

4、散一般出現(xiàn)這個(gè)現(xiàn)象有方面的,一是硬件,即內(nèi)存方面有問題,二是軟件,這就有多方面的問題了。

5、在“開始”菜單里面點(diǎn)“運(yùn)行”輸入“cmd”,對電腦進(jìn)行調(diào)試,具體步驟如下。首先將usb設(shè)備插入計(jì)算機(jī)接口,然后在桌面左下角單擊“開始”菜單,單擊“運(yùn)行”命令,打開框中鍵入“cmd”命令,單擊“確定”按鈕。

6、解決方法 步驟一:停用 USB 0 控制器 根據(jù)不同的操作系統(tǒng)做以下操作:在 Windows 2000 Pro 操作系統(tǒng)中,依次點(diǎn)擊“開始”→“控制面板”→“系統(tǒng)”。

求助一個(gè)關(guān)于Linux下的VASP故障的問題

1、ERROR FEXCF: supplied exchange-correlation table is too small, maximal index : 912695 這個(gè)問題是由于intel編譯器的問題,(我猜)天河上用intel可能是2013 or 2015。

2、用VASP DFT計(jì)算能帶時(shí)我需要考慮自旋軌道耦合(SOC)我的問題如下:(1)計(jì)算時(shí),在INCAR中加入SOC的參數(shù),是考慮在SCF自洽時(shí)加,還是在 band計(jì)算加入。

3、VASP程序用多了,經(jīng)常目錄下會留下不少的WAVECAR,CHGCAR等文件。如果不用的話,占用很大的磁盤空間。

4、請教一下大家一些問題,我用的軟件是VASP:首先對于吸附計(jì)算來說,一開始要進(jìn)行吸附材料的結(jié)構(gòu)優(yōu)化計(jì)算。

虛擬機(jī)下的linux安裝VASP可行么

1、redhat4 可以直接su 然后輸入你裝系統(tǒng)設(shè)置的密碼,進(jìn)到root下。

2、裝VASP運(yùn)行肯定是可以的,只是計(jì)算稍大點(diǎn)的體系速度就慢得要命了,你可以直接裝linux系統(tǒng)或是裝虛擬機(jī)的linux系統(tǒng)。完成某個(gè)獨(dú)立任務(wù)的程序及其所需的數(shù)據(jù)組成一個(gè)作業(yè)。

3、啟動(dòng)Windows 10操作系統(tǒng),點(diǎn)擊任務(wù)欄開始按鈕,彈出開始菜單選擇VMware→VMware Workstation項(xiàng)。喚出VMware Workstation 10程序窗口。點(diǎn)擊創(chuàng)建新的虛擬機(jī)圖標(biāo),通過虛擬機(jī)安裝操系統(tǒng)。

4、linux下的可執(zhí)行圖標(biāo)和shell終端圖標(biāo)很像 E、到/usr/bin目錄里找安裝的軟件啟動(dòng)文件執(zhí)行命令。

5、下載一個(gè)redhat,因?yàn)閞edhat已經(jīng)商業(yè)化了,推薦大家使用centos,如果自己有合適的linux安裝版本,可以不使用這個(gè)。

6、用戶可以通過vmware、virtualbox等虛擬機(jī)來安裝linux系統(tǒng)。使用虛擬機(jī)來安裝linux主要分為兩步,第一步是創(chuàng)建虛擬機(jī),第二步是安裝系統(tǒng),接下來以virtualbox安裝centos為例來簡要說明安裝步驟,僅供參考。

本文標(biāo)題:vasp中l(wèi)inux命令 vasp instructor
瀏覽路徑:http://aaarwkj.com/article12/dihoodc.html

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